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 mercredi-13-decembre-2023-a-14h/
SUMMARY:Soutenance de Thèse Vincent MOULIA - Mercredi 13 Décembre 2023 à
  14h
DESCRIPTION:Vincent MOULIA\nsoutiendra sa thèse le Mercredi 13 Décembre 
 à 13h30\n\n"Devenir des microbiomes le long du continuum eaux usées trai
 tées /\n systèmes de micro-irrigation / sol"\n&nbsp\;\n\n&nbsp\;\n\ndeva
 nt le jury composé de :\n\n- Etienne PAUL\, Professeur\, TBI INSA - Toulo
 use - Rapporteur\n- Fabrice MARTIN-LAURENT\, Directeur de recherche\, INRA
 E UMR Agroécologie - Dijon - Rapporteur\n- Laurence MATHIEU\, Maître de 
 conférence\, EPHE-PSL - Nancy - Examinatrice\n- Claire ALBASI\, Directric
 e de recherche\, Laboratoire de génie chimique - Toulouse - Examinatrice\
 n- Marc HERAN\, Professeur\, Institut Européens des membranes - Montpelli
 er - Directeur de thèse\n- Nassim AIT-MOUHEB\, Chargé de recherche\, INR
 AE UMR GEAU - Montpellier - Directeur de thèse\n- Nathalie WERY\, Directr
 ice de recherche\, INRAE Laboratoire de Biotechnologie de l’Environnemen
 t - Narbonne - Encadrante\n- Geoffroy LESAGE\, Maître de conférence\, In
 stitut européens des membranes - Montpellier - Encadrant\n- Jérôme HAME
 LIN\, Directeur de recherche\, INRAE Laboratoire de Biotechnologie de l’
 Environnement - Narbonne - Encadrant\n\n&nbsp\;\n\nRésumé :\n\nLa thèse
  s’inscrit dans projet MUSE ALLEA qui a pour ambition d’apporter une v
 ision transversale et multi-échelle sur l’impact de la réutilisation d
 es eaux usées traitées en irrigation\, et plus particulièrement de cons
 olider les connaissances sur le devenir des flux de polluants biologiques 
 et chimiques le long du continuum eau usée/système d’irrigation/sol/pl
 ante. Les essais ont été réalisés sur la plateforme expérimentale de 
 réutilisation des eaux de Murviel-lès-Montpellier\, lors de la culture e
 n serre de salades mais aussi lors d’irrigation en plein champs. Quatre 
 qualités d’eau différentes ont été utilisées : une eau contenant to
 ute la matière organique\, tous les nutriments et les bactéries anthropi
 ques (Eau brute : RWW)\, une eau contenant peu de matières organiques mai
 s des nutriments et des bactéries issues du système d’assainissement (
 Eau de sortie de station Lit plantés de roseau à aération forcée : CWW
 ) une eau contenant peu de matières organiques mais des nutriments et dé
 pourvue de bactéries (Eau de sortie d’un Bioréacteur à Membranes : MB
 W) et une eau témoin (Eau du robinet : TW). Les outils d’analyses\, dé
 ployés sur les matrices eau et sol\, comme la biologie moléculaire (séq
 uençage NGS\, ddPCR et qPCR)\, couplés à des observations microscopique
 s (tomographie en cohérence optique) ont permis de caractériser les micr
 obiomes du point de vue de leur composition\, richesse et diversité. Alor
 s que d’autres outils ont permis de quantifier la matière organique et 
 les principaux ions (Fluorescence 3DEEM\, chromatographie ionique\, COT\, 
 DCO\, ...). La structure des communautés bactériennes du sol a connu un 
 impact gradué avec trois groupes différenciés : sols irrigués avec l
 ’eau potable d’une part\, sols irrigués avec les eaux usées brutes d
 ’autre part et enfin les sols irrigués par les deux types d’eaux usé
 es traitées\, non différenciables entre eux. De plus\, la réponse en bi
 omasse des bactéries fonctionnelles liées au cycle de l’azote a été 
 proportionnelle à la quantité de composés azotés apportés. En parall
 èle\, les concentrations en bactéries d’origines entériques n’ont p
 u être quantifiées et détectées que dans les sols irrigués par les ea
 ux usées brutes et non dans les sols irrigués par les eaux usées trait
 ées.\n\nLe réseau de micro-irrigation a été étudié à échelle réel
 le pendant quatre mois\, en échantillonnant à la fois les goutteurs et l
 es conduites. Ces conduites possédaient des goutteurs avec des débits et
  des régimes d’écoulement différents. L’efficacité des réseaux d
 ’irrigation n’a pas été impactée par les différents régime d’é
 coulement dans les conditions expérimentales étudiées : l’uniformité
  a été maintenue tout le long du réseau d’irrigation. La position sur
  le réseau (début\, milieu et fin de ligne) n’impacte pas significativ
 ement le niveau de colmatage évalué par tomographie en cohérence optiqu
 e (OCT) (dans des goutteurs possédant un accès optique) et par quantific
 ation des bactéries.\n\nEnfin\, la dernière partie de la thèse s’est 
 intéressée aux interactions entre l’eau en transit dans le système d
 ’irrigation goutte à goutte et le développement du biofilm\, afin d’
 évaluer si la présence des biofilms modifie le microbiome de l’eau en 
 transit et les concentrations en bactéries indésirables (pathogènes ent
 ériques et espèces opportunistes). Les résultats ont montré que la str
 ucture des communautés bactériennes des eaux d’irrigations pouvait êt
 re influencée par les biofilms et que c'était plutôt le cas après plus
 ieurs mois d’irrigation. Cependant cette modification n'entraîne pas de
  contamination supplémentaire des eaux d’irrigations par des pathogène
 s opportunistes tels que Legionella pneumophila ou Aeromonas hydrophyla. A
 lors qu’il pouvait y avoir une dégradation de la qualité microbiologiq
 ue de l’eau provoquée par Escherichia coli dans le cas d’un biofilm p
 lus mature où de plus fortes concentrations ont été trouvées dans les 
 eaux de sortie. Ces travaux de thèse ont pour but d’approfondir les con
 naissances sur les risques écologiques\, sanitaires et techniques de la r
 éutilisation à l’échelle terrain.
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